Le Lycée de Morcenx est desservi de manière quotidienne par la SNCF, depuis les gares de Bordeaux, Facture-Biganos, Mont de Marsan, Dax, Bayonne et Pau.
L'établissement est situé à 10 minutes de la sortie n°14 de l'autoroute A63.
Les bus de ramassage scolaire desservant les communes proches (Labouheyre, Lesperon, Levignacq, Mezos, Ousse, Rion, Ygos) permettent également de rejoindre le lycée.